Совет молодых ученых при Министерстве образования Республики Беларусь сотрудничает с:

−        Республиканским общественным объединением «Белая Русь»;

−        Белорусским республиканским союзом молодежи;

−        Федерацией профсоюзов Беларуси;

−        Общественным объединением «Белорусский союз женщин»;

−        Республиканским молодежным центром;

−        Республиканским советом работающей молодежи;

−        Общественным республиканским студенческим советом;

−        Республиканским волонтерским центром.

Советом молодых ученых подписаны соглашения о сотрудничестве с:

1.      Советом молодых ученых Национальной академии наук Беларуси;

2.      Общественным объединением «Белорусский республиканский союз молодежи»;

3.      Высшим Советом молодых ученых при Министерстве образования и науки Кыргызстана;

4.      Республиканским советом работающей молодежи и Общественным республиканским студенческим советом;

5.      Учреждением образования «Национальный детский технопарк»

6.      Первичной организацией «Союз молодёжи Узбекистана»

7.      Молодежной Академией при Министерстве Высшего Образования Науки и Инновации Узбекистана.